這個時候被拒之門外的孔融一家人，內心里肯定也是很不服氣的，小孔融這個時候就對著門衛說：“我們家和你家大人是世交！”之后孔融等人果然進到了李府。見到了李膺之后，李膺就問他：“我從來沒聽說你啊，咱倆是什麼親戚呀？”孔融這時候絲毫不見膽怯，反而大大方方對李膺講到：“你的祖先是老子李耳，而我的祖先是孔子，他們還是師徒關系呢，這不算是世交嗎？”

其實孔融的祖先是孔子這個靠譜，但是李膺的祖先是不是李耳，那可就是不一定的事了。

李膺見小孔融如此聰慧，反應機敏，而且絲毫不怯場，敢說敢言，所以對小孔融是贊不絕口，表示這孩子長大了之后肯定能夠大有作為，能成大器。但是這個時候有一位名叫陳韙的官員，他對孔融的行為非常的不滿，并且評價說：小時候聰明，長大了可未必。而小孔融聽了他的話也一點沒慣著他，直接回懟道：“那想必您小時候，一定非常聰明吧！”

由此看來，小時候的孔融的確聰慧機智，而且膽子也很大，絕對不是一般的老實孩子。

在孔融十六歲的時候，張儉因為得罪了宦官集團，被中常侍侯覽視為眼中釘，并下命令要各地官員活捉張儉。而張儉和孔融的哥哥孔褒是好兄弟，所以張儉就想著去找孔褒躲躲，結果當時正好趕上孔褒不在家，所以孔融就接待了他。

因為當時的孔融只有十六歲，所以張儉并不想將自己的問題告訴孔融，只能支支吾吾，說是找他哥哥。但張儉雖然嘴上不肯多說，臉上卻是寫滿了窘迫，聰慧的孔融怎麼可能看不出來呢。于是孔融就表示自己也能作為東道主招待他，之后就收留了張儉住下了。但是這個張儉得罪的畢竟是當時如日中天的宦官集團，所以這個事很快就東窗事發了。

此事東窗事發之后，張儉跑了，孔融與哥哥孔褒卻被連累入獄，為了替哥哥頂罪，孔融表示藏匿張儉都是自己一人的決定，與哥哥無關。但哥哥孔褒也不能眼看著孔融為了自己入獄，所以也表示張儉找的是自己，弟弟是無辜的。

這兄弟倆都想為對方頂罪，這一時間辦案的官吏也不知道該怎麼辦好，于是就去問他們的母親。但這個時候他們的母親也表示，兒子出問題都是做家長的責任，所以這個罪過應該在自己。

這一家人都說是自己責任，都愿意為了家人承擔罪責，確實是很讓人感動，但最后朝廷還是下詔書定了孔褒的罪，孔融無罪釋放，并因此小有名聲。

孔融進入到官場的第一步，是受到楊賜的賞識，讓他任職司徒掾屬。孔融當時在暗中調查官僚之中的貪污受賄官員，加以處罰整治。但有意思的是，孔融檢舉的這些官員之中大多數都是官宦的家族，也就宦官們的親戚。在東漢末年，朝廷上下沒有不怕得罪宦官集團的，所以對于孔融的這個做法，朝中的官員們都很害怕，但是孔融卻絲毫不怕，甚至還在揭發這些宦官親戚的違法事實的時候，絲毫沒有客氣。