但是孔融畢竟是名士，要是就像殺豬一樣直接給殺了的話，那以后就更沒人支持董卓了，董卓當時剛接管朝政，本來這朝堂上下愿意支持他的人就少，所以董卓不敢輕易殺他。但董卓可以把孔融趕緊調走，調的離自己遠遠的，再也不用煩自己，為此董卓還特意挑選了一個最不太平，黃巾軍最為猖狂的地方，北海國。

孔融作為一為有名之士，怎麼能夠眼看著賊寇猖獗而沒有作為呢？但是北海國這個地方就是連董卓那樣的軍閥都會感到頭疼，孔融作為一個沒有一兵一卒的名士，能制服的了黃巾軍嗎？

孔融到了北海之后，也做了一系列的準備工作，想辦法召集人馬，想辦法勸說百姓和士兵，與周圍的郡縣通氣做準備，大家一起共同對抗黃巾軍。之后還設立學校，宣揚儒術，并善待投奔他的百姓，對待所有人都以禮相待，這個時期的孔融可以說是聲名大噪，在群眾內心的影響力越來越大，江湖人送外號“孔北海”。

可孔融畢竟是一介儒生，他做的這些準備，對于打仗也沒太大用處，由此可見孔融在行軍打仗方面恐怕是有所欠缺的，更何況他的對手還是讓軍閥都頭疼的黃巾軍，所以沒過多久，孔融就被管亥帶人給包圍了。

就在這樣的緊要關頭，孔融選擇了向劉備求救。這可樂壞了劉備，劉備驚喜道：“孔北海知天下又劉備耶？”可見劉備當時是多麼的小透明，又有多麼的想出名。

可為什麼孔融選擇的是劉備，而不是向曹操、袁紹這樣的大軍閥呢？

其實原因很簡單，當時的曹操和袁紹已經逐漸成為了北方最大的兩股勢力，所以孔融認為，這倆人早晚是要篡漢的，孔融的官職雖然一直不高，但是他的風骨很高。當時的士族們多多少少都是有一些傲氣，因為他的名人傲氣，他覺得照顧百姓是應該的，因為他的傲氣，他覺得董卓是叛逆的、是天理難容的，而現如今的大軍閥曹操和袁紹，與董卓也沒有什麼區別，所以在孔融眼里，董卓、袁紹、曹操都算是亂臣賊子，是他嗤之以鼻的。孔融的性格，多少有點非黑即白的意思。

孔融的這種思想和他狂妄的性格，勢必會得罪很多的將軍，這一次黃巾軍的危機依靠著劉備化解了，那下一次呢？

沒過多久袁紹的兒子袁譚又殺過來了。這次可不會再有劉備的幫助了，孔融只能自己帶兵硬上，結果打著打著，孔融這邊人越打越少，慢慢的就剩下幾百人了。天空中亂箭橫飛，打的孔融連還手之力都沒有，只能躲在屋子里，躲在桌子底下，干等著失敗。最后袁譚霸占了青州，孔融連夜逃跑，連妻兒都沒顧得上，全被袁譚給一鍋端了。

直到建安元年，漢獻帝被曹操迎接到了許都，曹操迎奉天子之后，征召孔融入朝為將作大匠，這孔融才算有了正當去處。

而孔融重新進入到朝堂之后，可以看的出來，孔融的內心是忠于東漢皇室的，心懷天下的心意是好的。比如說他阻止恢復肉刑，維護皇室顏面等等，從這些方面我們不難看出，孔融其實是對于漢室來說是忠臣，而且他也是一個心懷大志的人。